Come nella sala 5 del Museo della Verna, anche nella 6 il materiale esposto è molto. Qui però, a parte due tele di inizio Settecento e una "Vera Effige di San Francesco" del seicento, il materiale presente ha ben poco a vedere con spiritualità e sacralità. Non per niente questa sala è chiamata anche "sala della scienza". Gran parte degli oggetti esposti avevano a che fare con l'antichissima e famosa farmacia del santuario che ha origini nel Quattrocento e è durata fino agli anni '50 del secolo scorso quando è morto l'ultimo speziale: Fra' Achille. Un ritratto di questa grande figura del Convento Francescano si trova nello stretto corridoio che dalla sala 6 conduce al "fuoco comune". Fu realizzato nel 1961 da Baccio Maria Bacci.